{"id":27152,"date":"2024-07-22T18:48:19","date_gmt":"2024-07-22T21:48:19","guid":{"rendered":"https:\/\/uenf.br\/portal\/?p=27152"},"modified":"2024-07-22T18:48:19","modified_gmt":"2024-07-22T21:48:19","slug":"projetos-de-pesquisa-da-uenf-poderao-ser-executados-em-supercomputador","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/portal1.uenf.br\/portal\/destaques\/projetos-de-pesquisa-da-uenf-poderao-ser-executados-em-supercomputador\/","title":{"rendered":"Projetos de pesquisa da UENF poder\u00e3o ser executados em supercomputador"},"content":{"rendered":"
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Professor Jo\u00e3o Luiz de Almeida Filho foi convidado para treinamento no equipamento do LNCC<\/figcaption><\/figure>\n

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 <\/p>\n

A UENF poder\u00e1 ter projetos de pesquisa executados no supercomputador Santos Dumont do Laborat\u00f3rio Nacional de Computa\u00e7\u00e3o Cient\u00edfica (LNCC), localizado no munic\u00edpio de Petr\u00f3polis-RJ. O professor da UENF Jo\u00e3o Luiz de Almeida Filho foi convidado para realizar um treinamento no equipamento, o que poder\u00e1 gerar benef\u00edcios para a universidade. O pesquisador do Laborat\u00f3rio de Ci\u00eancias Matem\u00e1ticas (LCMAT) do Centro de Ci\u00eancia e Tecnologia (CCT), que tem experi\u00eancia com computa\u00e7\u00e3o de alto desempenho, informa que, durante o seu doutorado na UENF, participou de um treinamento no LNCC e teve a oportunidade de conhecer o supercomputador Santos Dumont.<\/p>\n

\u2014 Experimentos que necessitam de grande poder de processamento ser\u00e3o os mais beneficiados. Exemplos incluem simula\u00e7\u00f5es e modelagens para estudos meteorol\u00f3gicos, mapeamento de \u00e1reas para explora\u00e7\u00e3o de petr\u00f3leo, prospec\u00e7\u00e3o de medicamentos, que \u00e9 uma das minhas linhas de pesquisa, e outras an\u00e1lises de big data em diversos campos de estudo, considerando big data conjuntos de dados extremamente grandes e complexos que exigem este tipo de processamento avan\u00e7ado e o uso de um supercomputador pode acelerar significativamente sua an\u00e1lise e interpreta\u00e7\u00e3o \u2014 afirma Jo\u00e3o Luiz.<\/p>\n

Coopera\u00e7\u00e3o da UENF com o LNCC<\/strong><\/p>\n

O professor afirma que, com um usu\u00e1rio habilitado para operar o supercomputador Santos Dumont, a execu\u00e7\u00e3o dos projetos de pesquisa da UENF neste equipamento ser\u00e1 significativamente facilitada.<\/p>\n

\u2014 Com o meu treinamento, poderei auxiliar os outros pesquisadores que tenham projetos que necessitem deste tipo de equipamento. Acredito tamb\u00e9m que facilitar\u00e1 a coopera\u00e7\u00e3o entre as duas institui\u00e7\u00f5es, a UENF e o LNCC. Ser\u00e1 um benef\u00edcio para toda universidade. A ideia \u00e9 que, ap\u00f3s o treinamento, a universidade tenha um profissional capacitado com experi\u00eancia no uso desse supercomputador, que possa orientar e facilitar a utiliza\u00e7\u00e3o do mesmo. Dessa forma, poderemos fomentar o acesso a este tipo de equipamento dentro da nossa institui\u00e7\u00e3o \u2014 considera Jo\u00e3o Luiz.<\/p>\n

O pesquisador ressalta que o acesso ao supercomputador \u00e9 remoto, feito pela internet, e que nenhum usu\u00e1rio tem o total controle do supercomputador.<\/p>\n

\u2014 Para cada usu\u00e1rio \u00e9 dada uma sess\u00e3o onde s\u00e3o alocados os recursos necess\u00e1rios para que ele possa fazer o seu experimento, e esta ser\u00e1 a sua cota. Estes recursos podem ser usados em processadores ou espa\u00e7o em disco. Funciona como uma nuvem, como o Google Drive. No caso do supercomputador, a cota est\u00e1 relacionada com a aloca\u00e7\u00e3o de processadores \u2014 destaca Jo\u00e3o Luiz.<\/p>\n

Pesquisa de doutorado<\/strong><\/p>\n

O pesquisador informa que seu interesse em utilizar o supercomputador Santos Dumont vem desde a d\u00e9cada passada para aumentar a velocidade do HTP SurflexDock<\/em>, uma ferramenta online que permite fazer o virtual screening<\/em>, que foi desenvolvido durante o seu doutorado.<\/p>\n

\u2014 O virtual screening<\/em> \u00e9 uma “peneira digital” que permite identificar quais mol\u00e9culas t\u00eam maior probabilidade de se ligar a um alvo biol\u00f3gico espec\u00edfico. O virtual screening<\/em> pode analisar milhares de mol\u00e9culas em quest\u00e3o de horas ou dias, algo que levaria meses ou anos no laborat\u00f3rio. Isso acelera a identifica\u00e7\u00e3o de candidatos promissores, permitindo que os pesquisadores avancem mais rapidamente para testes cl\u00ednicos \u2014 considera Jo\u00e3o Luiz.<\/p>\n

Durante o seu p\u00f3s-doutorado, o HTP SurflexDock<\/em> foi utilizado para prospectar medicamentos para a Covid-19, ainda em 2020.<\/p>\n

\u2014 Tradicionalmente, durante a pesquisa e desenvolvimento de medicamentos s\u00e3o testados fisicamente milhares ou milh\u00f5es de compostos em laborat\u00f3rio. No entanto, existe uma metodologia de bioinform\u00e1tica chamada virtual screening<\/em>. Os resultados foram publicados no artigo \u201cIdentification of Hypericin as a Candidate Repurposed Therapeutic Agent for COVID-19 and Its Potential Anti-SARS-CoV-2 Activity\u201d<\/a> \u2014\u00a0 informa Jo\u00e3o Luiz.<\/p>\n

Supercomputador Santos Dumont\u00a0 – <\/strong>Uma das mais potentes m\u00e1quinas de computa\u00e7\u00e3o de alto desempenho da Am\u00e9rica Latina, o supercomputador Santos Dumont foi projetado para processar grandes volumes de dados em alta velocidade, com uma capacidade de processamento de 5,1 Petaflops, o que significa que ele pode realizar 5,1 x 1015<\/sup> de opera\u00e7\u00f5es matem\u00e1ticas por segundo. Para efeito de compara\u00e7\u00e3o, os computadores pessoais podem operar na casa de 1 x 1012<\/sup> de opera\u00e7\u00f5es por segundo. Este supercomputador alcan\u00e7a seu desempenho utilizando milhares de n\u00facleos de processamento h\u00edbridos, combinando CPUs e GPUs. Seu poder de processamento \u00e9 \u00fatil para uma variedade de aplica\u00e7\u00f5es cient\u00edficas, incluindo simula\u00e7\u00f5es clim\u00e1ticas e meteorol\u00f3gicas, modelagem de fen\u00f4menos geof\u00edsicos, pesquisas em f\u00edsica de part\u00edculas e astrof\u00edsica, estudos sobre energia renov\u00e1vel e efici\u00eancia energ\u00e9tica, bioinform\u00e1tica, simula\u00e7\u00f5es de prote\u00ednas e genomas, e desenvolvimento de novos medicamentos. Mais informa\u00e7\u00f5es em: https:\/\/sdumont.lncc.br\/<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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